Przekształcenie spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę komandytową nie podlega opodatkowaniu podatkowi od czynności cywilnoprawnych. Spółka komandytowa w świetle krajowego prawa handlowego jest niewątpliwie spółką osobową, jednak na potrzeby aktualnie obowiązującej Dyrektywy Kapitałowej oraz opodatkowania podatkiem kapitałowym na podstawie ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych uznana być musi za spółkę kapitałową – z uwagi na pierwszeństwo stosowania prawa wspólnotowego.
Spółka kapitałowa, będąc podmiotem o charakterze mieszanym, spełnia bowiem kryteria określone w art. 2 ust. 1 lit c Dyrektywy Kapitałowej w części, w jakiej dotyczy komandytariusza. Pomimo bowiem mieszanego charakteru tego rodzaju spółki są także spółkami, o których mowa w art. 2 ust. 1 lit. c Dyrektywy Kapitałowej, gdyż z literalnego brzmienia Dyrektywy Kapitałowej nie wynika, aby intencją ustawodawcy było wyłączenie spod hipotezy przywołanego przepisu podmiotów o charakterze mieszanym. Wątpliwości natomiast nie ma, jeżeli chodzi o spółkę kapitałowo-akcyjną, która stanowi spółkę kapitałową w rozumieniu przepisów dyrektywy kapitałowej.
Nie można zatem ograniczyć zakresu wyłączenia z opodatkowania do „klasycznych spółek kapitałowych” ocenianych wyłącznie według definicji z ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych, pomijając jednak przepisy Dyrektywy Kapitałowej oraz Dyrektywy 69/335 oraz zasadę stand-still.
Pomimo zmiany formy prawnej, działalność gospodarcza będzie kontynuowana przy wykorzystaniu tego samego majątku przez spółkę przekształconą. Do zwiększenia majątku spółki przekształconej doszłoby wyłącznie w przypadku, gdyby którykolwiek z dotychczasowych wspólników wniósł do spółki przekształconej w procesie przekształcenia nowe wkłady.
Wartość kapitału własnego spółki przekształcanej w stosunku do wartości kapitału podstawowego spółki komandytowej (spółki przekształconej) pozostanie niezmieniona. W ujęciu bilansowym wartość oraz struktura kapitału własnego spółki przekształconej będzie równa wartości kapitału własnego spółki komandytowo-akcyjnej przed przekształceniem, wskazał w wyroku z dnia 27 kwietnia 2016 r. WSA w Gdańsku (I SA/Gd 373/16).