Można powiedzieć, że stosowanie przez podatników split payment do regulowania zobowiązań będzie dawało kilka niewielkich korzyści, w wyniku spełnienia warunku „dobrej wiary”. Dzięki stosowaniu split payment podatnicy zyskają to, że:
- do zaległości w podatku powstałej za okres rozliczeniowy, za który podatnik w złożonej deklaracji podatkowej wykazał kwotę podatku naliczonego, której co najmniej 95% wynika z otrzymanych przez niego faktur, które zostały zapłacone z zastosowaniem mechanizmu podzielonej płatności, nie będzie miał zastosowania przepis art. 56b Ordynacji podatkowej, czyli podwyższone odsetki od zaległości podatkowych (stawka 150% rocznie),
- podwyższone odsetki (stawka 150%) nie będą miały zastosowania do zaległości podatkowej w VAT, jeżeli zaległość podatkowa przekracza dwukrotność kwoty podatku naliczonego wykazanej w złożonej deklaracji podatkowej,
- do wysokości kwoty podatku odpowiadającej kwocie podatku wynikającej z otrzymanej faktury zapłaconej z zastosowaniem mechanizmu podzielonej płatności nie będą miały zastosowania przepisy o solidarnej odpowiedzialności oraz nakładające sankcje watowskie:
- przepisy art. 105a ust. 1 ustawy o VAT, regulujące solidarną odpowiedzialność,
- przepisy art. 112b ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT, przewidujące sankcja 30% – w deklaracji,
- przepisy art. 112b ust. 2 pkt 1 ustawy o VAT, dotyczący sankcji 20% – w deklaracji
- przepisy art. 112c ustawy o VAT, nakładające sankcję 100%.
Na wniosek podatnika, złożony wraz z deklaracją podatkową, urząd skarbowy będzie zobowiązany dokonać zwrotu różnicy podatku, o której mowa w art. 87 ust. 2 ustawy o VAT, na rachunek VAT podatnika w terminie 25 dni, licząc od dnia złożenia rozliczenia.
Zwrot różnicy podatku będzie dokonywany przez urząd skarbowy przy użyciu komunikatu przelewu, w którym urząd skarbowy wskazuje odpowiednio:
- kwotę odpowiadającą zwracanej kwocie różnicy podatku;
- okres rozliczeniowy, którego dotyczy wniosek o zwrot;
- numer, za pomocą którego podatnik jest zidentyfikowany na potrzeby podatku.
Natomiast jeżeli zapłata zobowiązania podatkowego z tytułu podatku VAT nastąpi w całości z rachunku VAT w terminie wcześniejszym niż termin określony dla zapłaty podatku, kwotę zobowiązania podatkowego z tytułu podatku do zapłaty można obniżyć o kwotę wyliczoną według wzoru:
S=Z·R·N/360
gdzie:
S – oznacza kwotę, o którą obniża się kwotę zapłaty zobowiązania podatkowego z tytułu podatku, wyrażoną w zaokrągleniu do pełnych złotych,
Z – oznacza kwotę zobowiązania podatkowego z tytułu podatku wynikającą z deklaracji podatkowej przed obniżeniem tego zobowiązania,
R – oznacza stopę referencyjną Narodowego Banku Polskiego obowiązującą na dwa dni robocze przed dniem zapłaty podatku,
N – oznacza liczbę dni od dnia, w którym zlecono przelew, z wyłączeniem tego dnia, do terminu określonego dla zapłaty podatku, włącznie z tym dniem.
Do zaokrąglenia kwoty, o którą obniża się kwotę zapłaty zobowiązania podatkowego z tytułu podatku, będzie miał zastosowanie przepis art. 63 § 1 Ordynacji podatkowej.